计算ruby汉明距离的最有效方法?
在ruby中,计算两个无符号整数之间的位差(例如汉明距离)的最有效方法是什么?
例如,我有整数a = 2323409845和b = 1782647144。
他们的二进制表示是:
a = 10001010011111000110101110110101 b = 01101010010000010000100101101000
a&b之间的位差为17 ..
我可以对它们进行逻辑XOR,但这会给我一个不同的整数!= 17,然后我必须迭代结果的二进制表示并计算1的#。
计算位差的最有效方法是什么?
现在,答案是否会改变以计算许多整数序列的比特差异? 例如,给定2个无符号整数序列:
x = {2323409845,641760420,509499086....} y = {uint,uint,uint...}
计算两个序列之间的比特差异的最有效方法是什么?
你会迭代序列,还是有更快的方法来计算整个序列的差异?
您可以在Ruby中使用优化的String函数来进行位计数,而不是纯算术。 通过一些快速基准测试,结果大约快6倍。
def h2(a, b) (a^b).to_s(2).count("1") end
h1是计算的常规方法,而h2将xor转换为字符串,并计算“1”的数量
基准测试:
ruby-1.9.2-p180:001:0>> def h1(a, b) ruby-1.9.2-p180:002:1*> ret = 0 ruby-1.9.2-p180:003:1*> xor = a ^ b ruby-1.9.2-p180:004:1*> until xor == 0 ruby-1.9.2-p180:005:2*> ret += 1 ruby-1.9.2-p180:006:2*> xor &= xor - 1 ruby-1.9.2-p180:007:2*> end ruby-1.9.2-p180:008:1*> ret ruby-1.9.2-p180:009:1*> end # => nil ruby-1.9.2-p180:010:0>> def h2(a, b) ruby-1.9.2-p180:011:1*> (a^b).to_s(2).count("1") ruby-1.9.2-p180:012:1*> end # => nil ruby-1.9.2-p180:013:0>> h1(2323409845, 1782647144) # => 17 ruby-1.9.2-p180:014:0>> h2(2323409845, 1782647144) # => 17 ruby-1.9.2-p180:015:0>> quickbench(10**5) { h1(2323409845, 1782647144) } Rehearsal ------------------------------------ 2.060000 0.000000 2.060000 ( 1.944690) --------------------------- total: 2.060000sec user system total real 1.990000 0.000000 1.990000 ( 1.958056) # => nil ruby-1.9.2-p180:016:0>> quickbench(10**5) { h2(2323409845, 1782647144) } Rehearsal ------------------------------------ 0.340000 0.000000 0.340000 ( 0.333673) --------------------------- total: 0.340000sec user system total real 0.320000 0.000000 0.320000 ( 0.326854) # => nil ruby-1.9.2-p180:017:0>>
根据mu的建议太短,我写了一个简单的C扩展来使用__builtin_popcount,并使用基准测试validation它至少比ruby的优化字符串函数快3倍。
我查看了以下两个教程:
- 使用C扩展Ruby
- 在5分钟内在C语言中进行Ruby扩展
在我的计划中:
require './FastPopcount/fastpopcount.so' include FastPopcount def hamming(a,b) popcount(a^b) end
然后在包含我的程序的目录中,我使用以下文件创建一个文件夹“PopCount”。
extconf.rb:
# Loads mkmf which is used to make makefiles for Ruby extensions require 'mkmf' # Give it a name extension_name = 'fastpopcount' # The destination dir_config(extension_name) # Do the work create_makefile(extension_name)
popcount.c:
// Include the Ruby headers and goodies #include "ruby.h" // Defining a space for information and references about the module to be stored internally VALUE FastPopcount = Qnil; // Prototype for the initialization method - Ruby calls this, not you void Init_fastpopcount(); // Prototype for our method 'popcount' - methods are prefixed by 'method_' here VALUE method_popcount(int argc, VALUE *argv, VALUE self); // The initialization method for this module void Init_fastpopcount() { FastPopcount = rb_define_module("FastPopcount"); rb_define_method(FastPopcount, "popcount", method_popcount, 1); } // Our 'popcount' method.. it uses the builtin popcount VALUE method_popcount(int argc, VALUE *argv, VALUE self) { return INT2NUM(__builtin_popcount(NUM2UINT(argv))); }
然后在popcount目录下运行:
ruby extconf.rb make
然后运行程序,在那里你有它….在ruby中做汉明距离的最快方法。
Wegner算法:
def hamm_dist(a, b) dist = 0 val = a ^ b while not val.zero? dist += 1 val &= val - 1 end dist end p hamm_dist(2323409845, 1782647144) # => 17
如果有人想要遵循基于c的路径,最好将编译器标志-msse4.2
添加到makefile中。 这允许编译器生成基于硬件的popcnt
指令,而不是使用表来生成popcount。 在我的系统上,这大约快了2.5倍。